時計あわせの方法はNTPサーバを利用した設定方法がメジャーかと。
WindowsXP以降ならタスクバーの時計をダブルクリックしてそこから設定できます。簡単です。
ドメインに参加しているPCなら自動でドメインコントローラにあわせるようになっているようです。簡単です。
XP以前であれば桜時計を使って設定するのが楽かな、と。

ドメインコントローラは外部のNTPサーバと同期を取らなくてはいけません。そうしないとドメインに参加しているPCの時計が全部ずれてしまいます。いけません。
ドメインコントローラの時計あわせ方法はこんな感じです。

コマンドプロンプトで
net time /setsntp:NTPサーバのIPアドレス
と。詳細はnet time /helpをご覧下さい。わかりやすいです。

指定するNTPサーバの選択についてはWiki@nothingが役に立ちます。

あとはw32timeサービスの自動起動をしておけばいいです。そのうち時計が合わせられます。
合ってるかどうかは独立行政法人情報通信研究機構が提供している標準時を見ればいいでしょう。

こちらのOSがWindows Server 2003の時は必要に応じて
KB875424 Windows Server 2003 で Windows 以外の NTP サーバーとの同期が成功しない
も見る必要があるかもしれません。